化学肥料污染是在农业生产中因施用大量化学肥料而引起水体、土壤和大气的污染。任何种类和形态的化肥，施用到农田后，都不可能全部被植物吸收和利用。化肥用量过大，使用化肥不当，或施用化肥后作物利用率不高，导致化肥大量流失，都会造成污染。如今，化肥被视为仅次于农药的污染源，造成的危害也与农药旗鼓相当。化肥污染引起的环境问题主要有：一是使水源污染，造成人们生活用水的短缺，并因饮用被污染的水源而致健康损害。二是导致河川、湖泊、内海的富营养化，造成水草繁生，许多水塘、水库、湖泊因此变臭，成为死水。三是使土壤酸化以及物理性质恶化，一旦土壤中某种元素过剩，还会造成土壤对其他元素的吸收性能下降，从而破坏了土壤的内在平衡，导致土壤板结。四是化肥中所含有害物质污染土壤和作物，使产品品质低劣，危害人体健康。五是大气中氮氧化物含量增加，化肥中的氮元素等进入大气后，增加了温室气体，导致环境温度升高。

为了减少化肥污染造成的损害，人们现在正在寻求积极的解决之道。采取的主要措施主要有：

1、不要盲目加大肥料用量或长期过量使用同一种肥料，科学掌握施肥时间、次数和用量，最好采用分层施肥、深施肥等方法减少化肥损失，提高肥料利用率。

2、化肥与有机肥配合使用，增强土壤保肥能力和化肥利用率，减少水分和养分流失，使土质疏松，防止土壤板结。

3、进行测土配方施肥，增加磷肥、钾肥和微肥的用量，通过土壤中磷、钾以及各种微量元素的作用，降低农作物中硝酸盐的含量，提高农作物品种。

4、制定防止化肥污染的法律法规和无公害农产品施肥技术规范，使农产品生产过程中肥料的使用有章可循、有法可依，有效控制化肥对土壤、水源和农产品产生的污染。